Podłoża mikrobiologiczne są wykorzystywane do hodowli mikroorganizmów w kontrolowanym środowisku. Większość podłoży mikrobiologicznych jest wykonana z agaru, galaretowatej substancji pochodzącej z wodorostów, która dostarcza składników odżywczych do wzrostu mikroorganizmów. Inne rodzaje podłoży mikrobiologicznych to roztwory peptonów i hodowle bulionowe.
Aby wyhodować kulturę mikroorganizmów przy użyciu podłoży mikrobiologicznych, należy najpierw wysterylizować podłoże poprzez podgrzanie go do temperatury około 82 stopni Celsjusza. Następnie należy wymieszać próbkę ze sterylizowanym podłożem i pozwolić mu ostygnąć przed zaszczepieniem hodowli próbką. Po zaszczepieniu hodowli próbką, należy umieścić ją w inkubatorze o kontrolowanej temperaturze i wilgotności. Inkubator powinien być utrzymywany w temperaturze 35-37 stopni Celsjusza przy wilgotności 85%. Po jednym lub dwóch dniach hodowla powinna wykazywać oznaki wzrostu, takie jak zmętnienie lub zmętnienie w fazie płynnej hodowli.
Generalnie podłoża mikrobiologiczne dzielą się na dwa rodzaje – podłoża płynne oraz stałe. Pożywki płynne są stosowane do hodowli bakterii i innych mikroorganizmów. Znajdują się one w probówkach lub kolbach, a podłoże składa się zazwyczaj z płynnej bazy, składników odżywczych i soli. Podłoża stałe są używane do hodowli grzybów, drożdży i wirusów. Podłoże stałe to zazwyczaj proszek agarowy lub agar-agar, który jest następnie mieszany z wodą przed wlaniem do szalek Petriego, aby zestalił się w żelowe struktury, które zawierają składniki odżywcze wspomagające wzrost mikroorganizmów.